Sí se ha estudiado que las personas con la enfermedad de Behçet, presentan una mayor frecuencia de un tipo de antígenos leucocitarios humanos (HLA) que el resto de la población, lo que podría indicar una mayor predisposición a padecer la enfermedad. El HLA es un conjunto de moléculas que tienen como función reconocer aquello que es ajeno al organismo y poner en marcha la respuesta inmunitaria. Su estructura determina la aceptación de tejidos en los trasplantes y también se ha relacionado con una mayor probabilidad de enfermedades autoinmunes, con el síndrome de Behçet.