Si la sclérose en plaques est causée par la maladie de Lyme, il est nécessaire d'arrêter les lésions et le processus dégénératif et de récupérer autant que possible la capacité de réponse du patient. Dans ce traitement, il faudrait non seulement réguler le système immunitaire mais aussi éliminer les infections actives chez cette personne (borrelia, babesia, erlichia, chlamydia pneumonia, qui produisent une pathologie douloureuse).